Năm 1975, ngay khi đất nước thống nhất, tại TP. HCM, cơ quan Xuất bản và Thiết bị trường học được thành lập, trực thuộc Bộ Giáo dục, trên cơ sở tiếp quản Trung tâm Học liệu của chế độ cũ, với đội ngũ cán bộ từ ba nguồn hợp lại: cán bộ của Trung tâm Học liệu ở lại, cán bộ từ chiến khu về, cán bộ của Nhà xuất bản Giáo dục (NXBGD) từ Hà Nội tăng cường vào.

Khai giảng năm học đầu tiên sau ngày đất nước thống nhất, học sinh các tỉnh, thành phố phía Nam đã được học SGK hệ 12 năm được Cơ quan Xuất bản và Thiết bị trường học tiếp nhận từ Trại sách B, do Bộ Giáo dục – được Đảng và Chính phủ, với tầm nhìn chiến lược, chỉ đạo – tổ chức biên soạn trong những năm 1972 – 1975.

Ngày 17/7/1976, Bộ Giáo dục đã có Quyết định thành lập Chi nhánh Cục Xuất bản tại TP. Hồ Chí Minh trực thuộc Cục Xuất bản (Bộ Giáo dục).

Ngày 20/1/1979, chuẩn bị biên soạn sách giáo khoa cải cách giáo dục lần thứ ba, Bộ Giáo dục ban hành Quyết định số 87/QĐ thành lập Chi nhánh NXBGD tại TP. HCM, trên cơ sở tách bộ phận xuất bản ra khỏi Chi nhánh Cục Xuất bản tại TP. Hồ Chí Minh, trở thành một đơn vị hạch toán kinh tế, trực thuộc NXBGD. Sự kiện này đánh dấu sự ra đời của NXBGD tại TP. HCM.

Với gần 30 nhân sự và 3 phòng chuyên môn lúc mới thành lập, Chi nhánh NXBGD tại TP. HCM đã không ngừng lớn mạnh về quy mô và chức năng, nhiệm vụ. Đến đầu những năm 2000, đơn vị có đến gần 180 nhân sự với 19 phòng ban, tham gia tất cả các hoạt động của NXBGD, bao gồm các lần làm sách giáo khoa mới.

Năm 2003, NXBGD (năm 2010 đổi tên thành NXBGD Việt Nam) chuyển đổi hoạt động theo mô hình công ty mẹ – công ty con, Chi nhánh NXBGD tại TP. HCM là một đơn vị trược thuộc Công ty mẹ, và được gọi tên là NXBGD tại TP. HCM. Những năm sau đó cho đến năm 2010, nhiều bộ phận của NXBGD tại TP. HCM được tách ra thành lập các công ty cổ phần, trở thành các đơn vị thành viên của NXBGD Việt Nam trong khu vực.

Hiện nay, NXBGD tại TP. HCM có cơ cấu tổ chức gồm Ban Giám đốc, Kế toán trưởng và 4 phòng chức năng là Phòng Quản lí xuất bản, Phòng Tài chính, Phòng Tổ chức – Hành chính – Quản trị và Phòng Kế hoạch in – phát hành.

1. Ông Nguyễn Thành Anh – Giám đốc NXBGD tại TP. Hồ Chí Minh

2. Ông Từ Trung Đan – Phó Giám đốc

3. Ông Vũ Bùi Biển – Phó Giám đốc

4. Ông Nguyễn Thanh Hữu – Kế toán trưởng

Ông Trần Trâm Phương (1979 – 1989)	Ông Trần Bá Huy (1989 – 1992)
Ông Nguyễn Khương Đắc (1992 – 1996)	Bà Trần Thị Thanh Triều (1996)
Ông Ngô Trần Ái (1997 – 2000)	Ông Vũ Bá Hòa (2000 – 2010)
Ông Xà Thiệu Hoàng (2010 – 2015)	Ông Phạm Văn Hồng (2015 – 2017)
Ông Đỗ Thành Lâm (2017 – 2025)	Ông Nguyễn Thành Anh (2025 – nay)